大部分原发性甲状腺功能减退症是不能根治的，如果停药，症状肯定会复发，所以需要长期用药治疗。而一过性的甲减，比如药物性甲减，急性、亚急性甲状腺炎症引起的甲减，随着疾病的进展会恢复，复发的可能性比较小。
一旦确诊为甲状腺功能减退，要明确引起甲减的病因，常见的病因有桥本甲状腺炎、甲状腺放射碘治疗、甲状腺手术切除。
原发性甲状腺功能减退要及时地补充甲状腺激素，在药物治疗过程中，还需要定期检查甲状腺功能，根据甲状腺激素以及促甲状腺激素的结果，调整药物的剂量。
