大部分甲状腺功能减退症的患者预后比较良好，可以和健康人群一样工作和生活，关键在于早期明确诊断，早期的干预治疗。
确诊以后，应及时地补充甲状腺激素替代治疗，并且定期检查甲状腺功能，调整药物的剂量，把甲状腺功能稳定在正常的范围，甲减的症状才能得到缓解。
如果没有及时得到的诊治，容易诱发甲减严重的并发症，比如甲状腺功能减退性心脏病，表现为心脏扩大、心率减低、心包积液、心衰等等。甚至出现黏液性水肿昏迷，出现休克、低氧血症、呼吸暂停，甚至导致死亡。
