基底节出血与脑干出血的区别主要在于出血位置以及脑损伤的症状。
在解剖定位方面，不同区域的脑组织有其相应命名，如出血位置位于基底节区附近，定性为基底节出血。如出血位置在脑干附近，定性为脑干出血。
在临床症状方面，基底节出血后可因出血量不同而出现相应临床症状，大多表现在对侧肢体感觉运动功能障碍、吞咽言语功能障碍等情况。如脑干区域出血，则患者临床症状表现较为复杂，一方面可表现出嗜睡、觉醒功能障碍、昏迷等意识障碍症状，一方面可表现出感觉运动功能异常，严重者可出体温、呼吸、心率等中枢性生命体征不平稳症状。
