肾囊肿发生的原因目前还不是十分清楚，考虑可能与以下因素有关：
由肾小管憩室发展而来；也可能是先天发育不良；也考虑是基因突变：可能在胚胎形成过程中，由于各种因素作用使基因发生突变所致；可能与上呼吸道感染、尿路感染、胃肠道感染等也有关系。
肾囊肿的病变可以是单侧，也可以是双侧，一般是呈现孤立球形，临床一般无明显的症状。有少数患者会有腰痛、腹痛、腹部肿块、血尿，以及继发感染相关表现。如果囊肿过大，还可能造成局部的压迫症状。
