女人小便的时候尿道刺痛，最常见的原因是尿路感染，因为女性尿道比较短，离生殖道距离较短，因此相对容易引起感染。感染以后因为局部反应、细菌影响，可引起尿道的炎症反应，在排尿过程中尿液可能会渗透到尿道组织，引起明显的疼痛感。
如果患有尿道结石或膀胱结石等也可出现小便时尿道内的刺痛。如果尿道周围存在病变引起的尿道反应，如充血、水肿也可以引起刺痛，如尿道旁腺感染、前庭大腺感染、阴道炎等。如果有过膀胱镜或导尿等的医源性操作，也可能出现尿道内刺痛、肉眼血尿等。
