大部分的尿道结石是由膀胱的结石掉入尿道所导致的，临床症状主要包括疼痛、排尿困难、血尿等等。疼痛是因为上尿路结石下排过程中，突然嵌顿造成局部剧烈疼痛及排尿痛。尿道结石常阻塞尿道可出现排尿困难，甚至可出现急性尿潴留，常伴有血尿，与结石对尿道的刺激损伤有关。
如果尿道结石出现时间过长，感染后会导致尿道溃烂，甚至会并发严重的阴囊、会阴部感染。其他的症状，可以导致尿道狭窄、尿道周围脓肿及尿道皮肤瘘，甚至引起上尿路的继发性损害。
