肾结石在治疗时需要结合患者的综合情况治疗，才能起到好的治疗效果。
如果是比较小的结石，可在医生指导下，使用相应的药物促进结石排出。对于因肾结石所引起的疼痛，也可以使用非甾体的抗炎类药物缓解疼痛，必要时可配合解痉药物。
如果结石比较大，则需要采取手术治疗，需要根据结石的部位以及结石的大小决定具体的手术方案。常见的手术包括体外冲击波碎石术、经皮肾镜碎石术以及输尿管镜碎石取石术等。
如5-20mm的结石可采取体外冲击碎石术；对于直径大于2cm的肾结石，则可采取经皮肾镜碎石术；小于2cm的肾结石可采取输尿管镜碎石取石术。
