真性红细胞增多症的发病原因尚不清楚，可能与基因突变或者其他因素有关。真性红细胞增多症是一种获得性的造血干细胞克隆性增殖的疾病，其发病机制可能是：1、干细胞不受控制地增生；2、干细胞多EPO的反应性增强；3、与基因突变有关。真性红细胞增多症患者大多存在JAK2V617F基因突变。但是目前引起真性红细胞增多症的具体病因尚未明确，大多数人认为与上述基因突变有关。有一些学者认为真性红细胞增多症可能与病毒感染或者电离辐射等因素有关，但仍缺乏可靠依据。
