大便发酸味可能与日常饮食结构有关。若是过多食用肉类、豆类、牛奶等高蛋白且高营养的食物，人体不能够完全吸收，在代谢过程中可能会产生大量的吲哚，造成大便发酸。
其次，若患者患有急性胃肠炎或是肠道感染，肠道受到刺激后蠕动速度过快，会导致粪便在肠道中存留时间过短，不能完全与碱性粘液发生中和，从而造成大便发酸的现象。
除此之外，若患者几天没有排便，大量的细菌、微生物分解代谢会产生酸性的物质，从而造成大便带有酸臭的味道。
