肛瘘的危害主要有以下几方面：
1、感染流脓：肛瘘感染发炎后，肛门疼痛剧烈，溃破后脓水污染内裤，脓液刺激局部皮肤，肛门瘙痒剧烈。长此以往导致精神不振、抵抗力下降等，严重影响生活。
2、瘘口、瘘管增加：肛瘘反复发作，脓液可穿破管壁沿着括约肌间隙蔓延而形成多发性、复杂性肛瘘，为治疗增加难度，还可能会影响肛门生理功能。
3、癌变风险：肛瘘的多发性，可形成直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，若病史超过十年则有癌变风险。
4、肛门失禁：如果未及时治疗肛瘘，可能会对括约肌造成严重损伤，甚至导致出现肛门失禁等严重并发症。
