肝癌根据病因不同，又可分为原发性肝癌与继发性肝癌。主要由遗传因素、感染、生活方式以及其他疾病引起。
首先，原发性肝癌大多由病毒性肝炎引起，尤其以感染乙型肝炎病毒与丙型肝炎病毒居多。
其次，长期酗酒抽烟的患者，其原发性肝癌的患病率，相较其他人来说较高。而若患者饮食不注意，经常食用霉变的食物、被毒素污染的食物与水、含有亚硝酸胺的食物，或是缺乏微量元素的食物，都可增加患有肝癌的风险。而肝硬化、2型糖尿病的患者患有肝癌的几率较大，因此需要及时控制病情，防止恶变。
若患有结肠癌、胃癌、胰腺癌等癌症，可转移至肝脏，即继发性肝癌。
