染色体异常通常不能治疗，属于遗传基因疾病。
染色体异常目前没有特殊的治疗方法，孕期需要全面检查尽量避免染色体患儿分娩。染色体异常临床上以唐氏综合征、特纳氏综合征、13-三体综合征和18-三体综合征为多见，大部分染色体异常患儿在胚胎期即会自然流产，有部分存活甚至分娩，但儿童期夭折的可能性相对较大。
如果孕前检查提示夫妻双方或者有一方有染色体疾病，尤其是有家族遗传病史，通常建议选择第三代试管婴儿，通过筛查以及诊断可以避免染色体疾病患儿分娩。
