导致出现肺结节的疾病有多种，常见的类型有呼吸系统感染性疾病、肺尘埃沉着病、肺结核、肺良性肿瘤、肺恶性肿瘤、免疫系统疾病等。疾病导致肺组织发生渗出、出现肉芽肿样增生、不典型异常增生等，导致肺内出现直径小于3cm的结节样病灶。
不同病因导致的肺结节良恶性不同，例如肺炎、肺真菌病、肺结核、肺炎性假瘤、错构瘤等肺良性肿瘤，以及多血管炎性肉芽肿、韦格氏肉芽肿、IgG4病、类风湿病累及肺部等免疫系统疾病，导致的肺结节为良性，根据病因进行抗感染、抗真菌、抗结核治疗、或使用激素、微创手术等即可。而肺癌、肺转移瘤导致的则为肺恶性结节，需进行抗肿瘤治疗。
