扁平疣是人类乳头瘤病毒感染所引起。可以通过直接或间接接触互相传染。扁平疣一般呈慢性病程，有时可以突然自行消失，但大多数可以持续多年不愈和，愈后不留瘢痕。所以，扁平疣还是要进行积极的治疗，以免造成自身播散或者传染给他人。
产生这种现象的原因可能是因为人乳头瘤病毒的生存依赖于角质形成细胞，当角质形成细胞逐渐走向凋往时，病毒也随之消失。另外，能否自愈和所感染的乳头瘤病毒的分型也有关系。
