扁平疣是由于人乳头瘤病毒也就是HPV病毒感染引起的，一般是接触感染引起的。外伤或皮肤破损对HPV感染也是一个重要因素。人乳头瘤病毒有一百多种亚型，由于其亚型不同，引起的疾病也不同。可以引起扁平疣的人乳头瘤病毒亚型，主要是3型人乳头瘤病毒等。2、4、10、28、41、65型人乳头瘤病毒也会引起扁平疣。扁平疣的好发部位是颜面部、手背部等，皮损为扁平的米粒至绿豆大小的丘疹，有时会出现瘙痒。扁平疣具有自愈倾向。
