通常临床医生可以根据相应的临床表现以及检查来判断是否患有卵巢囊肿。
实验室检查：判断患者是否有感染和炎症、怀孕；检查各项激素水平；
B超检查：能够确定囊肿的位置及物质，能够判断囊肿是生理性的，还是病理性的；B超检查女性朋友注意避开排卵期。
CT和核磁：在B超检查完后，必要时可进行CT、核磁检查。
肿瘤标记物检查：能够初步筛查癌症标志物，如果患者肿瘤标记物阳性，可能存在某种肿瘤，如抗原标志物CA125，CA125都是卵巢肿瘤的标记物。
腹腔镜探查：能够直接观测到患者腹腔的情况，同时除了检查之外，还能帮助患者治疗。
