衣原体感染的症状因感染部位和个体差异而异，可表现为泌尿生殖道症状、眼部症状、呼吸道症状或无症状感染。
泌尿生殖道感染常见排尿疼痛、尿频、异常分泌物（男性尿道口分泌物，女性阴道分泌物）。眼部感染可导致结膜炎、眼睑肿胀、分泌物增多。呼吸道感染表现为咳嗽、喉咙痛、支气管炎。许多感染者无明显症状。女性长期感染可能导致不孕。男性可能并发附睾炎。部分患者会出现反应性关节炎。新生儿通过感染母亲产道可能发生眼炎或肺炎。潜伏期通常为1-3周，主要通过性接触传播，也可通过母婴传播。诊断依赖实验室检测，常用方法包括核酸扩增试验（NAAT）和培养，治疗首选抗生素如阿奇霉素或多西环素。
日常应注意保持良好的个人卫生，避免不安全性行为，定期进行性健康检查，感染期间避免性生活，遵医嘱完成全程治疗，并通知性伴侣进行检查，同时加强免疫力，保持健康生活方式以降低感染风险。
