霉菌性食道炎主要采用抗真菌药物治疗，常用药物包括氟康唑、伊曲康唑和制霉菌素等，通常需要口服给药，疗程一般为1-2周。
抗真菌药物治疗是霉菌性食道炎的核心，氟康唑作为首选药物，通常每日一次口服，伊曲康唑可作为替代选择，对于严重或耐药病例可考虑静脉给药；饮食调整应避免辛辣、过热和酸性食物，选择温和、易消化的软食，少食多餐；避免刺激性食物如酒精、咖啡、浓茶和碳酸饮料；增强免疫力包括保持充足睡眠、适度运动和均衡营养；治疗原发病如糖尿病、HIV感染或恶性肿瘤等基础疾病；定期复查评估治疗效果和调整治疗方案；注意口腔卫生可使用含氟牙膏和漱口水预防口腔真菌感染；避免滥用抗生素，因为广谱抗生素会破坏正常菌群平衡，增加真菌感染风险。
日常生活中，患者应保持良好的个人卫生习惯，餐具定期消毒，避免与感染者共用餐具，保持室内空气流通，穿着透气衣物，戒烟限酒，保持乐观心态，适当锻炼增强体质，并严格按照医嘱完成全程治疗，不可自行停药或减量，同时密切观察症状变化，如出现吞咽困难、胸痛或发热加重等情况应及时就医。
