查胚胎染色体有重要意义，尤其在辅助生殖技术、复发性流产管理以及遗传疾病预防领域。
胚胎染色体检查通过分析染色体数目或结构异常，可精准识别唐氏综合征、爱德华兹综合征等非整倍体疾病，这些异常是导致胚胎发育停滞、自然流产或出生后严重先天性疾病的主要原因。在试管婴儿技术中，胚胎植入前遗传学检测通过筛选染色体正常的胚胎进行移植，可提高着床率与临床妊娠率，同时降低因染色体异常引发的反复移植失败风险。
对于有复发性流产史的夫妇，胚胎染色体检查能明确病因是否与染色体异常相关，若多次检测发现胚胎存在染色体数目或结构异常，可能提示夫妇双方存在染色体平衡易位、罗伯逊易位等遗传问题，或生殖细胞发生染色体突变的倾向。此类信息可为医生制定个性化治疗方案提供依据，例如建议采用第三代试管婴儿技术或进行更深入的遗传咨询。
此外，胚胎染色体检查通过早期发现遗传缺陷，可避免严重遗传病患儿的出生，从而减轻家庭与社会负担。尽管该技术存在费用较高、伦理争议等局限性，但其在优化生育决策、保障母婴健康方面的价值已得到广泛认可。
