胚胎染色体异常的原因复杂多样，主要包括遗传因素、母体年龄因素、环境因素、精子与卵子质量、受精卵发育异常。
1.遗传因素：染色体异常具有一定的遗传倾向。如果父母双方或一方存在染色体异常，这些异常可能会通过基因遗传给下一代，导致胚胎染色体异常。遗传因素导致的染色体异常占出生缺陷的一定比例，是胚胎染色体异常的重要原因之一。
2.母体年龄因素：随着母体年龄的增长，卵细胞及纺锤丝的老化，遗传物质在传递过程中容易出现同源染色体不分离或姊妹染色单体不分离的情况。高龄孕妇（特别是40岁以上的孕妇）生出孩子患染色体异常的概率相对较高。
3.环境因素：孕妇在怀孕期间如果接触到过量的放射线、化学物质（如亚硝胺、铅元素、剧毒农药等）或某些病毒（如巨细胞病毒、水痘-带状疱疹病毒等），这些物质可能会损害胚胎的染色体，导致染色体异常或畸变。特别是在怀孕初期的3个月内，这是导致胎儿畸形的高度敏感期，环境因素对胚胎染色体异常的影响尤为明显。
4.精子与卵子质量：精子和卵子的质量对胚胎的染色体也有重要影响。如果男性的精子质量差，比如长期抽烟喝酒、接触化学毒物等，可能会影响到精子质量，进而引起胚胎染色体异常。女性在备孕前滥用抗生素、长期熬夜等不良生活习惯，也可能会对卵子质量造成影响，从而影响到胚胎的质量。
5.受精卵发育异常：在精子和卵子结合形成受精卵的过程中，如果发生异常，如染色体复制错误或配对失误，也可能导致胚胎染色体异常。
怀孕期间应定期孕检，以便及时了解胚胎的发育情况。
