益生菌禁忌人群通常有以下几种：
1、免疫缺陷的儿童。免疫缺陷的儿童服用益生菌，很容易造成这些细菌进入儿童的体内，使儿童出现贫血症。
2、对益生菌成分过敏者。对益生菌成分过敏者吃了益生菌后，可能会出现皮肤起丘疹、腹泻次数增加、胃部不适等情况。
3、乳糖吸收障碍的患者。益生菌中含有较多的乳糖成分，乳糖吸收障碍的患者吃了益生菌后，可能会导致体内大量乳糖堆积，从而产生乳酸酸中毒的症状。
4、有胃肠疾病的患者。当患者患有肠胃疾病时，益生菌中的活菌会通过出血黏膜的毛细血管进入血液循环中，使患者出现菌血症。此外，益生菌是不能同抗生素一起食用的，因为抗生素在杀灭有害菌的时候，也会把有益菌也死，让益生菌发挥不了作用。
