一般来说，溃疡性结肠炎的药物治疗效果较好，能在短时间内完全缓解患者的脓血便症状，但如果症状得到控制后立即停药，容易导致溃疡性结肠炎复发，所以，溃疡性结肠炎患者需要长久服药。
一般在医生的指导下，药物治疗至少需要维持两到三年。5-氨基水杨酸、免疫抑制剂和生物制剂，可用于溃疡性结肠炎的长期维持治疗，而激素仅能短期应用，不能用于长期维持治疗。
另外，过去疗效较好的治疗方案，对于复发的溃疡性结肠炎无法起到良好的治疗效果，所以溃疡性结肠炎症状缓解后，应该减量应用相关药物，然后逐步停药，以避免溃疡性结肠炎的复发。
