骨髓移植配型成功率需要根据不同的情况来确定。
骨髓移植需要进行组织相容性配型，也就是HLA配型。一般地，父母和血亲子女之间配型呈典型的半相合，也就是半数位点相合。而同父母兄弟姐妹之间配型全相合的概率为25%，半相合的概率为50%。同卵双生子，也就是一个受精卵发育为两个胚胎，出生后他们之间的基因型完全一致，HLA配型也完全相合。当然这需要通过特殊的基因测序来进行鉴定。
对于非血缘性供者，也就是常说的不相识的健康志愿供者和患者配型全相合的概率则低至十万分之一到二十万分之一。随着中华骨髓库入库登记志愿捐献人群数量的增加，已经可以基本满足骨髓移植临床配型的需要。
