根管治疗第二次是去除失活剂，并且进行根管的预备，此步骤极为重要。
一般情况下，根管治疗的第一次是在麻醉的状态下进行开髓，然后进行引流或者是封失活剂。根管第二次应该是去除根管内的失活剂，并且反复冲洗，开始进行根管的预备。根管治疗的第三次，多半是对根管进行换药，消炎处理。根管治疗的第四次就是根管的充填，隔绝外界刺激，杜绝再次感染。
如果失活剂没有去除干净或者根管预备不完全，就会导致根管治疗的失败，患者还会反复感染发生残髓炎或者根尖周炎，第二次看诊时间较长。
