角膜屈光手术后遗症有很多。但现在临床上一般采用飞秒激光手术，比如，飞秒激光微小切口基质透镜切除术，或飞秒激光辅助准分子激光原位角膜磨镶术等，出现的后遗症并不多。常见的有：
因为在手术的过程中切断了眼表神经，导致眼表的知觉下降，患者眨眼次数减少，从而引起干眼症。大多数患者会逐渐好转。
角膜切削的光学区域，如果超过暗室瞳孔直径，就会出现点光源发散、变形或者出现光圈的现象，表现为夜间眩光或光晕，也可能出现患者夜间视力下降。
与术后患者的角膜组织修复有关。一般情况下，术前近视度数越高，屈光回退的可能性就越大。
可能是术后没有注意眼部卫生以及护理，导致的眼部感染，引起的感染性角膜炎。
通常见于屈光度较高的患者，可能是角膜再生胶原纤维无序排列引起的。
可能与术后眼部外伤有关，导致角膜瓣移位，而出现角膜瓣移位或皱褶。
可能与术后长时间使用激素眼药水有关。
所以，角膜屈光手术后，患者要遵医嘱使用药物治疗，并定期复查，同时也要注意用眼卫生，注意休息，避免眼外伤及眼部感染等，才能有效的防止各种后遗症的发生。
