
文章导读
1、目前遗传学检测技术不断进步并应用于临床,可能发现大量“阳性”结果,更需要重视家系分析在致病性判断中的价值。
2、多次流产或生育力下降,或延迟显性以及成年发病者意外去世等可能掩盖先证者,某些遗传学现象也可影响对遗传方式的判断。表型采集、细化及其出现的年龄、死亡原因、生育史都至关重要。
3、在遗传咨询中,贝叶斯分析能够为疾病或携带的可能性提供个体化风险评估信息。
4、目前,芯片或低通量拷贝数变异测序平台在产前诊断中的应用日渐广泛,对检出的拷贝数变异致病性评估同样依赖亲缘分析。双亲样本的同时检测,联合家系分析对于锁定致病变异非常重要。
本文引用格式:马京梅,杨慧霞.家系分析在产前筛查诊断中的价值[J].中华围产医学杂志,2022,25(1):25-27.DOI:10.3760/cma.j.cn113903-20211201-00993
马京梅 杨慧霞
北京大学第一医院妇产科,北京100034通信作者:杨慧霞,Email:yanghuixia@bjmu.edu.cn,电话:010-83573246
家系分析有助于临床医生了解疾病的传递方式、分析检测结果,进而为家系其他成员提供检测建议。目前遗传学检测技术不断进步并应用于临床,可能发现大量“阳性”结果,更需要重视家系分析在致病性判断中的价值。
【关键词】产前诊断;系谱
基金项目:国家重点研发计划(2016YFC1000303)
近年来,随着新技术不断发展并应用于临床,从染色体核型分析[1]、聚合酶链反应[2]和Sanger测序技术[3],到染色体微阵列分析[4]和二代测序平台[5],使得临床对遗传性疾病的认识不断提高。国内外常规建立的产前筛查诊断体系,作为降低出生缺陷的二级防控体系,参与完成遗传性疾病诊疗到规避风险的闭环。新技术为智者善加利用。在上述过程中,家系分析所提供的信息帮助临床医生了解疾病的传递方式、分析检测结果,进而为家族其他成员提供检测建议,作为医学遗传学的基本环节和重要工具,家系分析不可或缺。
一、家系分析的定义
通过获取家族史信息,如个体性别、年龄、婚育情况、主要疾病、必要的遗传检测,以及家庭成员间的关系等,并采用树状系谱图进行总结的形式,称为家系分析,采用标准化符号简化并标注关键信息[6]。在系谱图中,出现遗传性疾病的患者称为先证者,而向医生/遗传咨询师展示家族情况的就诊者,称为咨询者(consultand),可能是先证者本人,也可能是其他家族成员,一个家族内可同时存在多名先证者,家族中的唯一先证者称为散发病例。家族关系根据家系层级,分为一级、二级及三级亲缘。共有祖先则为近亲。
先证者或其他具有临床表型者,是评估建立疾病遗传模式的关键因素,如存在不同症状/体征的表型,也应予以标注。通过家系分析,特别是以先证者为核心(而非局限于咨询者)的多代家族史信息,为疾病遗传方式提供了重要线索。单基因病常表现为孟德尔遗传方式,以某种特定模式在家族中传递。如表现为垂直传递,多代受累,先证者父母之一携带,每个子女有1/2的风险受累,男女机会均等,应考虑为常染色体显性遗传(autosomal dominant,AD),如软骨发育不全[8]和马方综合征[9]等。无家族史,某一代出现先证者,先证者父母正常,其子女有1/4患病风险,男女机会均等,近亲婚配增加风险,应考虑为常染色体隐性遗传(autosomal recessive,AR),如脊肌萎缩症[10]等。
性染色体中,X连锁隐性遗传表现为先证者多为家族男性成员,先证者母亲家系男性成员同时受累,先证者父母及子女不受累,先证者同胞男性有1/2患病风险,女性有1/2携带可能,如Duchenne肌营养不良(Duchennemusculardystrophy,DMD)[11],由于X染色体随机失活,女性携带者可能出现相对轻微表现,DMD致病变异携带者可表现为肌酸激酶水平增高;某些位点逃避随机失活,女性携带者不会出现表型,如鱼鳞病的STS基因。而X连锁显性遗传表现为垂直传递,多代受累,先证者父母之一携带,如父亲携带,则所有女性后代患病,所有男性后代健康;而母亲携带,则与AD类似。同样,由于X染色体随机失活,女性患者相对男性表现轻微/各异,如Rett综合征等[12]。
二、影响判定的可能因素
某些情况可能掩盖先证者,例如多次流产或生育力下降,或延迟显性以及成年发病者意外去世等。此外,某些遗传学现象也可影响对遗传方式的判断。如AD相关的遗传学现象:共显性、外显不全、表现度差异和基因多效性。其中,外显不全,是指由于其他因素的影响,并非所有携带个体均出现临床表型;表现度则对应临床表现的严重程度。因此,细化表型及其出现的年龄、死亡原因、生育史都至关重要。本期刊出“DLG3基因p.S434S同义变异导致智力障碍及产前诊断”[7]一文的家系3代成员中,4例男性患者出现智力发育落后征象,对14名家系成员进行共分离检测。
原则上,根据X连锁隐性遗传方式,评估可能的携带者,可适当减少检测对象;同时,现有系谱图中的男性成员均发病,且携带该变异,如能进一步围绕第二代先证者,向上追溯第一代男性成员,并对第一代男性成员中未出现表型者进行检测,如证实他们不携带该变异,可进一步完善变异评估的共分离证据。非经典孟德尔遗传中,基因组印记和动态突变是生殖相关遗传检测常遇到的遗传现象。其中,基因组印记现象是指致病变异亲缘性不同而导致的不同临床表型,由于某些印记基因仅限于父源或母源表达时行使正常功能,当出现单亲二体,或表观修饰、点突变等原因造成印记基因单一亲缘表达时,可出现表型。
如脆性X综合征[13],相关FMR1基因组织特异性高表达,正常人群CGG重复次数具有多态性,减数分裂过程中,前突变重复次数增加,称动态突变。患者变异来自母源前突变,呈X连锁遗传方式,当UTR区扩增变异达到一定次数时,外显完全,不论性别,表现为认知障碍。由于存在前突变,在男性可表现为脆性X震颤共济失调综合征,女性则可出现脆性X相关卵巢早衰。家族中存在智力障碍或在40岁前出现卵巢功能早衰者,可考虑排查脆性X综合征,并可能进一步指导生殖相关遗传检测。因此,对上述情况相关临床表型信息采集记录非常重要。
三、基于贝叶斯原理改进风险评估
当信息有限时,贝叶斯分析(Bayes)[14]也是评估风险的重要工具。作为概率论基本定律之一,贝叶斯分析包括如下步骤:根据家族史先证者情况和/或检测信息,或基于某种是或否的假说,计算某种状态的初始可能性的前概率,结合检测或家系分析后的可能性计算条件概率,进而得出联合概率(前概率×条件概率)和后概率(联合概率/不同假说对应的联合概率之和),通过分步计算进一步明确额外信息背景下个体某种假说的可能性。在遗传咨询中,贝叶斯分析能够为疾病或携带的可能性提供个体化风险评估信息。
四、新技术应用需要家系分析
目前,芯片或低通量拷贝数变异测序平台在产前诊断中的应用日渐广泛,对检出的拷贝数变异致病性评估同样依赖亲缘分析。本刊2021年第9期刊出的“染色体微阵列分析技术亲缘分析对判定拷贝数变异临床意义的影响”一文通过总结73例核心家系的检测结果,对此进行了充分讨论[15]。同样,外显子组测序平台可能检出大量变异,筛选致病变异的过程需要基于遗传方式考量。如AD方式,通常致病变异来自于具有类似临床表型的双亲之一。
由于某些“新发”变异出现在亲缘生殖细胞(卵细胞/精子)、受精卵或受精后突变,因而双亲外周血可能不能检出相同变异;同时,某些新发变异以嵌合形式存在,上述情况亦可见于AD方式。对于AR方式,受累个体通常同时携带来自双亲的致病变异,由于杂合携带状态,双亲不具临床表型,通常先证者携带同一基因的不同致病变异,称为复合杂合。如近亲婚配生育,受累个体可表现为纯合携带。
罕见情况下,还可出现同一致病通路上的双基因杂合致病变异发病的遗传方式。因而,双亲样本的同时检测,联合家系分析对于锁定致病变异非常重要。综上,当前新技术广泛应用于产前诊断,产前诊断过程中能够发现的“阳性”结果也不断增加。但阳性结果不等同于诊断,特别在产前,是否能够准确帮助临床进行后续决策,同时不造成过度诊疗,需要慎思笃行。完善家族史信息做好家系分析,确保相关人员的及时检测,是基础,也是关键。
作者:中华围产医学杂志
来源:马京梅 杨慧霞
