肛门指检和肠镜检查，各有利弊，无法明确哪个检查更准确，临床上通常需要结合两种检查方式，共同确诊病变，并进行后续治疗。
这种检查比较简便，在医生进行病史采集后，初步分析判断病变情况，就可以进行肛门指检。指导患者进行右侧卧位、蹲位或跪在床上，进行肛门局部润滑，佩戴手套就可以进行肛门指检。检查过程中，可以感觉肛门松紧度，是否有局部疼痛，肛管内部以及部分直肠区域是否有异常情况。脱下手套时，观察手套是否有染血的情况。由于手指长度有限，所以检查范围会受到影响。另外，在肛门指检过程中，检查医生的经验、手法非常重要。
该检查相对复杂，需要进行肠道清洁准备，尽量排空肠腔内粪便，才能进行肠镜检查。肠镜检查范围大，包括回盲部以及整个大肠、肛管区域，可以直观地看到肠壁的健康状况，对于发现的病变情况，可以钳取活体组织，通过病理学检查确诊最终病变。不过，肠镜检查过程中，无法像肛门指诊一样，和患者形成互动判断肠壁外部或肛管外部区域的病变情况。
因此，在临床工作中，并没有哪一项检查更准确的说法，往往采取两种检查相结合的方式，先进行肛门指检，再进行肠镜检查，确诊最终病变，再针对性治疗。
