亚急性甲状腺炎通常与病毒感染有关，由于病程长短不一，因此治疗周期会有所差异，但大多数患者在二到三个月左右可以治愈。
对于轻型的亚急性甲状腺炎的患者，治疗周期通常在两个月左右。亚急性甲状腺炎为自限性的疾病，因此在治疗上主要以减轻炎症反应以及缓解疼痛为主要目的，对于轻型的患者可给予非甾体抗炎类的药物缓解临床症状。
对于中型的亚急性甲状腺炎患者，单纯的采取非甾体抗炎类药物治疗效果并不是特别理想，由于患者的临床症状相对比较明显，因此，通常需要配合激素类药物进行联合治疗，治疗的周期通常在两个半月左右。
对于重型的亚急性甲状腺炎患者，除了要应用非甾体抗炎类药物以及激素类药物之外，对于心悸症状比较明显者，通常还需要给予β受体阻滞剂。重型的亚急性甲状腺炎者由于临床症状较重且持续时间较长，因此治疗的周期也会明显增长，通常在三个月左右。
