儿童胃食管反流病的发病率同样不低。出生后儿童的胃肠道和全身其他器官都在生长发育阶段，机能尚未健全，特别是消化道较为脆弱，神经系统也未完全发育，儿童无法准确感知饥饱，容易吃撑导致积食和反流。
其次儿童的贲门发育不完全，张力较低也容易发生反流。婴儿的胃呈横位，而成年人的胃则为沟型，横位胃更易发生反流。儿童成为胃食管反流的高危人群，这种反流通常是生理性的，只要采用科学的喂养方法，很少会发展为病理性反流。
儿童常见的漾奶现象实际上是一种胃食管反流但一般不视为疾病。如果父母缺乏科学喂养知识，过度漾奶可能导致意外事件，如胃食管反流严重时，食物可能误入气管引起窒息。研究发现儿童的窒息事件与反流密切相关。
有经验的家长在喂养时会将孩子抱起，保持头高脚低的姿势，避免过量喂养。喂奶后会将孩子竖直抱起拍嗝，帮助婴幼儿释放胃内气体降低胃压，减少反流的发生。科学喂养对儿童的生长发育和健康至关重要。
