甲亢和甲减并不存在直接的严重性对比，其对身体的损害，均与治疗的规范程度有关。
单纯的甲亢和甲减，如患者在医疗机构规范接受诊疗，其治疗效果大多较为理想，一般不会诱发严重并发症，但如不规范进行治疗，则可因严重并发症对身体产生损害。
例如甲亢患者不规范接受诊疗，可诱发甲亢性心脏病、甲亢性眼部疾病、甲状腺危象、甲亢性肝肾损伤等，严重者可存在致死致残后果。例如甲减患者不接受规范诊疗，可诱发黏液性水肿、心动过缓、心功能衰竭、身体矮小、智力下降等严重并发症，同样存在致死致残可能。
