食管癌术后一般情况下，最严重的并发症是吻合口瘘。
对于食管癌这种疾病来说，由于需要手术切除部分食管及部分胃组织，因此切除部分食管及胃组织后，需要重新给予重建消化道后的食管胃组织的吻合。所以食管癌术后就可能存在食管胃吻合口处的吻合口瘘，这是一种较为严重的并发症，如发现不及时或病情较重的话，导致严重的胸腔感染、脓胸致脓毒血症，而直接危及患者的生命。
此外，食管癌术后严重的肺部感染及肺不张情况的出现，可直接导致患者继发呼吸衰竭而危及生命。
