气管镜检查在部分情况下可以确诊肺癌。确诊肺癌需要病理学，至少是细胞学发现肺癌组织或肺癌细胞。气管镜检查时，如果可以取到病灶肺组织活检，或者通过刷检或者灌洗的方法获得肿瘤细胞，则可以确诊肺癌。
支气管镜通过主支气管及支气管分支可以到达癌肿部位，明确肿块的位置、形状、表面情况以及与周围组织的关系，同时对肿块组织切取标本送病理检查，如果病检结果提示癌变，即能对肺癌进行确诊，并且根据病理分型，制定具体的放疗、化疗等治疗方案。但随着临床上发现更多的早期肺癌，而且多位于肺的周边部位，所以通过普通的气管镜确诊肺癌的情况在临床上越来越少了。
