睡眠呼吸暂停低通气综合征大多数通过有效的干预措施，可以减少症状和减少并发症，预后良好。
睡眠呼吸暂停低通气综合征一旦确诊后，及早进行有效的干预措施，比如减肥、睡眠侧卧位、无创呼吸机的使用等治疗措施；存在上气道解剖异常的情况，及时采取手术治疗等，睡眠呼吸暂停低通气综合征的预后就会比较好，可以减少呼吸暂停和低氧的情况、预防并发症的出现。
但是有部分人，对睡眠呼吸暂停低通气综合征缺乏认识，出现症状后不够重视，没有及时进行干预，病情就会继续进展，甚至发生全身性的并发症，这种情况预后较差。
