多发性肾结石的治疗，要具体结合肾结石的大小、结石的数量、结石是否引起梗阻等选择合适的治疗方案：
一般来说，多发性肾结石只是说明结石数量比较多，如果结石比较小，特别是小于0.6cm的结石，很可能从肾内脱离。可以应用一些排石药物进行治疗，同时多喝水、多运动，促进结石掉落。
但是如果多发性肾结石比较大，结石无法从输尿管自行排出，需要根据患者的一般情况采用体外冲击波碎石或者微创手术治疗。临床常用的微创手术治疗方法有输尿管软镜碎石取石术和经皮肾镜碎石取石术。
