甲减（甲状腺功能减退）的病因包括原发性甲状腺疾病和中枢性疾病。
甲状腺功能减退最常见的病因是原发性甲状腺疾病所引起的，原发性甲状腺疾病中最常见的原因为桥本甲状腺炎（自身免疫性甲状腺炎），其次甲状腺肿瘤手术由于切除大部分甲状腺组织也会导致甲减，甲亢患者行碘131治疗或者甲亢手术也容易患有甲减。
甲减的少见原因是一些中枢神经系统疾病导致的中枢性甲减，比如垂体肿瘤或者垂体坏死等，会导致下丘脑-垂体-甲状腺轴受到破坏，而出现甲减。
