房间隔缺损的并发症和缺损的大小有关：
- 如果缺损比较大，会造成分流量较大，肺充血量明显，容易造成肺部感染。
- 右房血液经过缺损的部位会由左向右分流，可能会导致右心房容量负荷增加，从而引起右心房、右心室增大或肺动脉扩张。早期肺小动脉痉挛，随时间延长可形成阻力性肺动脉高压。当右心房压力高于左心房时，血液由右向左分流引起发绀，即艾森曼格综合征。
房间隔缺损主要是房间隔先天性发育不良导致，可能和遗传因素以及环境因素有关，比如胎儿在心脏发育阶段，任何不利的因素均可影响正常的发育。
为避免患儿出现不良并发症，如果房间隔缺损较大，要及时进行治疗。
