胃肠间质瘤无明确病因或发病因素，可能与c-kit基因及PDGFRA基因突变有关。
检测基因突变的位点，主要是c-kit基因的第9、11、13及17号外显子以及PDGFRA基因的第12和18号外显子。原发c-kit基因突变可表现为多种突变类型；突变与药物治疗的疗效有关；
建议平时要保持心情舒畅，精神愉快；经常锻炼，增强体质，提高机体免疫力及抗病能力；生活规律：起居有常，劳逸结合；饮食有节：合理搭配，忌暴饮暴食，细嚼慢咽，戒烟限酒；定期检查：40岁以上定期体检时加做胃肠镜，防患于未然。
