眼角膜薄主要有生理原因、病理原因和手术原因三大类，具体如下：
每个人的角膜都是有一定的厚度，一般不会随着年龄的增大而变薄，通常中央角膜较薄，周边较厚。有些人天生角膜就偏薄，而没有其他症状，一般不需要特殊治疗。
最主要的就是圆锥角膜以及婴幼儿时期发生的先天性青光眼，眼角膜的基质层会不断变薄，并且外突，如果不及时治疗有可能会出现角膜破裂、角膜疤痕，对视力造成严重影响。此外，高度近视有可能导致角膜轻微扩张、变薄。角膜炎、角膜烧伤、免疫性疾病等可能会导致角膜基质溶解、角膜变薄。
手术导致的角膜变薄多发生于近视患者激光矫正术后。近视手术的原理就是通过对角膜切削，从而改变角膜的屈光状态，从而达到矫正视力的目的。为了保证术后角膜厚度在安全范围内，在手术前，医生会综合考虑角膜厚度、近视度数、曲率等因素，以选择合适的手术方式。
