马拉色菌毛囊炎没有自愈倾向，一般不能自愈。
马拉色菌毛囊炎，是毛囊部位感染了马拉色菌后引起的炎症性病变，可能会导致毛囊部位的组织结构破坏。已经侵入毛囊部位的马拉色菌难以自行清除，在不进行治疗的情况下，一般都会长期存在，对毛囊部位的皮脂产生分解作用，使局部形成游离脂肪酸，刺激毛囊口反复发生炎症反应。炎症反应导致毛囊结构被破坏后，如果不进行治疗，通常也难以恢复正常状态。所以，马拉色菌毛囊炎一般都不会自愈。
确诊马拉色菌毛囊炎后需进行系统的抗真菌治疗，需要经过1-2个月才能逐渐恢复。
