进行主动脉夹层手术后的患者，可能会出现的并发症有脊髓缺血、急性肾功能衰竭、急性肝损伤、心包填塞、胸腔积血等。
当患者的主动脉夹层累及脊髓时，可能会引起脊髓的缺血，继而出现下肢的活动障碍，甚至是截瘫等。如果主动脉夹层引发肾脏缺血，往往会使患者突发少尿甚至无尿等急性肾功能衰竭的表现。如果主动脉夹层累积肝脏时，可能会引起肝脏的血流灌注量减少，从而引发急性肝损伤。
如果患者发生夹层的破裂，血液积聚在心包内，患者可能会突发呼吸困难、血压下降、心率增快等心包填塞的症状。另外，如果血液积聚在胸腔，患者可能会出现血氧下降、呼吸困难等胸腔积血症状。
