在临床当中，肝包虫病的检查主要是根据B超、CT、磁共振、免疫学检测等方法。
B超检查诊断准确率比较高，是筛查及诊断的首选检查方法，肝囊性包虫病B超检查显示出现双层壁囊肿结构及弧形钙化影。
CT和磁共振检查可以清楚的显示囊肿与肝内结构间的关系，对术前准备、手术规划和术中操作，都具有重要的临床意义。
免疫学检查常用的有酶联免疫吸附试验、间接血凝法等，免疫学是包虫病诊断和鉴别诊断的重要方法，临床中经常使用此检查辅助诊断肝包虫病。
