肝吸虫病确诊需要结合进食生鱼虾的病史，结合影像学检查，确诊需要在粪便或者十二指肠引流液中查到虫卵。
凡是有进食生鱼虾的历史，或是吃了未烧熟的鱼虾后，出现腹胀、腹泻等消化不良的表现，并且伴有肝肿大或其他肝胆系统疾病时，应当考虑到本病的可能。
确诊依赖于粪便直接涂片或浓缩法找虫卵，粪便多次阴性者，可以做十二指肠引流，采集胆汁找虫卵，免疫学检查如皮内试验、抗体检测等可以辅助诊断。
一旦确定肝吸虫病需要及时驱虫治疗，有营养不良或肝硬化症状者需要加强营养保护肝脏。
