如果FT3水平偏低，有可能是甲状腺功能减退症，也有可能是继发的低T3综合症。需要结合甲状腺功能其他的指标，以及临床症状、病史来综合的判断。
如果除了FT3水平偏低以外，还伴有促甲状腺激素水平的升高，那么就可以诊断为原发性甲状腺功能减退症，需要补充甲状腺激素替代治疗。在药物治疗的过程中，需要定期监测甲状腺功能，然后调整药物的剂量，尽可能使甲状腺功能稳定在正常范围，减少对人体的影响。
如果甲状腺功能单纯FT3水平偏低，其他甲功指标都正常，不排除其他疾病引起，需要积极的治疗原发疾病。
