甲状腺功能减退症的确诊需要做甲状腺功能的检查，甲状腺功能的检查包括T3、T4和TSH，甲减时T3和T4水平下降，TSH水平升高。TSH是促甲状腺激素，是垂体分泌的激素，主要作用是促进甲状腺激素合成和释放，所以当甲状腺由于各种原因导致甲状腺激素合成和分泌不足，机体会代偿性分泌促甲状腺素（也就是TSH）水平增加。
常见的引起甲状腺激素水平下降的原因一个是桥本甲状腺炎，另外也见于甲亢碘131治疗或者甲亢手术导致的甲减，甲状腺肿瘤手术后也会导致出现甲减。
临床上一旦怀疑甲减建议去医院查T3、T4和TSH水平，如果是怀孕妇女或者服用激素的患者需要查游离T3和游离T4，因为在上述患者中总T3和总T4不能准确反映体内甲状腺激素水平，需要测定游离T3和游离T4。
