线粒体脑肌病尚无法治愈。本病属于急性进展性疾病，大多数患者预后不良，具体的存活时间与疾病的情况有很大关系。对于疾病早期的患者，经及时有效的治疗后可延缓疾病进展，提高患者的生活质量。但若失于治疗，则会导致病情进一步加重，对患者的正常生活造成严重影响。
对于有严重心脏传导阻滞症状者，需要听从医生指导，使用心脏起搏器，维持心脏的正常传导工作。平时患者还可结合个人的身体情况，适当进行锻炼，提高肌肉力量，对于缓解病情也有很好作用。
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