原发性肝癌指标包括甲胎蛋白及其他肝癌标志物。
甲胎蛋白的产生是当肝细胞组织发生恶变时甲胎蛋白有关基因重新激活，合成甲胎蛋白后释放入血，出现含量增高，肝癌患者其水平会急剧上升，持续上升对于原发性肝癌普查、诊断、判断治疗效果及预测复发有着重要意义。
其他肝癌标志物，如γ-谷氨酰转移酶同工酶Ⅱ、异常凝血酶原、碱性磷酸酶同工酶等，对原发性肝癌的诊断及鉴别诊断也具有一定意义。
实验室检查对于确诊原发性肝癌仍有局限，需结合B超、增强CT、MRI或肝动脉造影等检查，必要时需要肝脏穿刺活检明确诊断。
