慢性乙肝的小三阳通常很难自愈，但成人急性乙肝小三阳大多数可自愈。
大多数的慢性乙型肝炎患者，小三阳是很难自身痊愈的，因为当机体被乙肝病毒感染后，很难将病毒完全清除，而转为慢性感染的状态。如果病毒持续高水平复制，对肝脏造成持续的损伤，则需要长期应用抗病毒药物来抑制乙肝病毒复制。
若成人急性感染乙肝病毒，化验检查乙肝5项表现为乙肝大三阳，但自身的免疫系统可以清除病毒，无需抗病毒治疗，大三阳很快可以转为小三阳，最后出现表面抗原阴转，达到临床自愈。
