霉菌性鼻窦炎不是一定要手术，但是临床上对于霉菌性鼻窦炎的治疗以手术治疗为主，保守治疗效果并不是很理想。
患者发病期间鼻窦内的霉菌团块容易导致病情复发和病程延长，而手术的主要目的是清除这种霉菌团块，单纯只通过药物治疗霉菌团块不易被完全清除。临床上对于上述病情的治疗以微创手术治疗为主，治疗过程中可以在鼻内窥镜下开放筛窦、上颌窦窦口，或通过扩大窦口等方法，将鼻窦内的霉菌团块清理干净。手术完成后，患者需要按照医生医嘱按时换药，部分患者需要配合抗霉菌类药物以及糖皮质激素类药物进行巩固治疗。
根据临床观察，手术治疗后多数霉菌性鼻窦炎的复发率会明显下降，预后比较好。但侵袭性真菌性鼻窦炎或者患者自身体质较差，则预后不好。
