亚临床甲状腺功能减退患者在妊娠期需要治疗。亚临床甲减患者后代神经系统发育会受到一定的影响。
目前采用甲状腺激素替代治疗，多次复诊检查甲功后逐渐调整药物用量，直至血清中促甲状腺激素达到正常妊娠期水平。
甲状腺激素替代药物作用慢而持久，半衰期约1周左右。开始服用药物后和调整剂量后，每2-4周检测1次血清TSH（促甲状腺激素）水平；TSH水平稳定后，每月检测1次甲功。如果出现甲状腺功能进行性的下降，则需要加大甲状腺激素的用量。
一般建议，若甲状腺球蛋白抗体和过氧化酶抗体高，TSH大于2.5uIU/ml，就启动甲状腺激素治疗；若抗体阴性，则大于4uIU/ml时启动治疗。总的原则，妊娠早期小于2.5uIU/ml，中后期小于3uIU/ml。
