结膜炎可能会复发。结膜不属于无菌的环境，受到不良因素的影响后，则会导致结膜炎复发。例如细菌感染、病毒感染、自身结膜囊抵抗能力低下等，均有可能会导致结膜炎发生。
结膜炎又分为多种的类型，其中复发几率最高的结膜炎类型为过敏性结膜炎。
过敏性结膜炎通常为过敏原刺激所导致，如再次接触过敏原，则会导致本病再次发生，比较常见的过敏原包括花粉、尘螨、动物皮毛等。由于此类过敏原在日常生活当中比较常见，因此本病的复发率也比较高，大多数患者需长期间歇性治疗。
